חסינות מולדת מיידית מתחילה 0-4 שעות לאחר החשיפה לגורם זיהומי וכוללת פעולה של מולקולות אנטי-מיקרוביאליות מסיסות מראש המסתובבות בדם, הנמצאות בנוזלי רקמות חוץ-תאיות, ומופרשות על ידי תאי אפיתל. אלה כוללים: אנזימים ופפטידים אנטי-מיקרוביאליים, וחלבוני מערכת משלימים. מולקולות אנטי-מיקרוביאליות מעוצבות אלה נועדו להתחיל מיד להסיר חומרים זיהומיים ברגע שהם נכנסים לגוף. בנוסף למולקולות אנטי-מיקרוביאליות שנוצרו מראש, הדברים הבאים ממלאים תפקיד גם בחסינות מולדת מיידית: מחסומים אנטומיים לזיהום, הסרה מכנית של חיידקים ואנטגוניזם חיידקי על ידי המיקרוביוטה הרגילה של הגוף
חסינות מולדת מיידית מתחילה 0-4 שעות לאחר החשיפה לחומר זיהומי וכוללת פעולה של מולקולות אנטי-מיקרוביאליות מסיסות מראש המסתובבות בדם ונמצאות בנוזלי רקמות חוץ-תאיות. ליזוזים, המצוי בדמעות, רירי, רוק, פלזמה, נוזל רקמות וכו ', מפרק פפטידוגליקן בחיידקים הגורמים לתמוגה אוסמוטית. פוספוליפאז A2 הוא אנזים החודר לדופן התא החיידקי ומבצע הידרוליזה של הפוספוליפידים בקרום הציטופלזמי החיידקי.
מערכת המשלים מתייחסת לסדרה של יותר מ-30 חלבונים מסיסים ומעוצבים מראש המסתובבים בדם ורוחצים את הנוזלים המקיפים את הרקמות. החלבונים מסתובבים בצורה לא פעילה, אך בתגובה להכרה במרכיבים מולקולריים של מיקרואורגניזם, הם מופעלים ברצף, עובדים במפל שבו בקשירה של חלבון אחד מקדם את הקישור של החלבון הבא במפל.
מחסומים אנטומיים כגון העור, הריריות והמעטפות הגרמיות הם מחסומים קשים ושלמים המונעים כניסה והתיישבות של חיידקים רבים. הסרה מכנית היא תהליך של שטיפה פיזית של חיידקים מהגוף. דוגמאות לכך כוללות ריר וסיליה, שיעול והתעטשות, הקאות ושלשולים ופעולת השטיפה של נוזלי הגוף. המיקרוביוטה הרגילה שומרת על פתוגנים אופורטוניסטיים שעלולים להזיק.