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9.3: 转录

在原核生物和真核生物中,DNA的第二个功能(第一个是复制)是提供构建所需蛋白质所需的信息,以便细胞能够发挥其所有功能。 为此,DNA 被 “读取” 或转录为 mRNA 分子。 然后,mRNA 提供通过称为翻译的过程形成蛋白质的密码。 通过转录和翻译过程,蛋白质由最初编码在 DNA 中的特定氨基酸序列构成。 本模块讨论转录的细节。

中心教条:DNA 编码 RNA;RNA 编码蛋白质

中心教条(图9.3.1)描述了细胞中遗传信息从DNA到mRNA再到蛋白质的流动,该教条指出,基因指定了mRNA的序列,而mRNA反过来又指定了蛋白质序列。

流程图显示了 DNA,箭头指向 RNA,箭头指向蛋白质。
9.3.1中心教条指出,DNA 对 RNA 进行编码,而后者反过来编码蛋白质。

将DNA复制到mRNA相对简单,在DNA链中读取的每一个互补核苷酸都会在mRNA链中添加一个核苷酸。 蛋白质的翻译更为复杂,因为由三个 mRNA 核苷酸组成的组对应于蛋白质序列中的一个氨基酸。 但是,正如我们将在下一个模块中看到的那样,蛋白质的翻译仍然是系统化的,因此核苷酸 1 到 3 对应于氨基酸 1,核苷酸 4 到 6 对应于氨基酸 2,依此类推。

转录:从 DNA 到 mRNA

原核生物和真核生物的转录过程基本相同,但真核生物中的膜结合核有重要区别。 当基因结合在细胞核中后,转录发生在细胞核中,mRNA转录本必须运送到细胞质中。 原核生物,包括细菌和古细菌,缺乏膜结合的核和其他细胞器,转录发生在细胞的细胞质中。 在原核生物和真核生物中,转录分为三个主要阶段:启动、伸长和终止。

启动

转录需要 DNA 双螺旋在 mRNA 合成区域部分解开。 放卷区域称为转录气泡。 参与转录的蛋白质和酶结合以启动转录过程的DNA序列被称为启动子。 在大多数情况下,启动子存在于它们调节的基因的上游。 启动子的特定序列非常重要,因为它决定了相应的基因是一直被转录,有时还是根本不被转录(图9.3.2)。

插图显示了 DNA 的模板链和非模板链,模板链上有一个红色的启动子部分。 启动子的下游是合成 RNA 的 RNA 聚合酶。
9.3.2转录的开始始于 DNA 解开,形成转录气泡。 参与转录的酶和其他蛋白质在启动子上结合。

伸长率

转录总是从两条 DNA 链中的一条进行,即所谓的模板链。 mRNA产物与模板链互补,与另一条称为非模板链的DNA链几乎相同,唯一的不同是RNA含有尿嘧啶(U)来代替DNA中发现的胸腺嘧啶(T)。 在伸长过程中,一种叫做 RNA 聚合酶的酶沿着 DNA 模板进行,通过碱基配对与 DNA 模板添加核苷酸,其方式类似于 DNA 复制,不同之处在于合成的 RNA 链不与 DNA 模板结合。 随着伸长率的推进,DNA在核心酶前面不断展开,然后在核心酶后面倒带(图9.3.3)。

插图显示了通过 RNA 聚合酶合成 RNA。 RNA 链是在 5' 到 3' 方向上合成的。
9.3.3在伸长过程中,RNA 聚合酶沿着 DNA 模板进行跟踪,在 5' 到 3' 方向上合成 mRNA,然后在读取 DNA 时展开,然后倒带 DNA。

终止

基因被转录后,需要指示原核聚合酶与DNA模板分离并释放出新产生的mRNA。 根据被转录的基因,有两种终止信号,但都涉及 DNA 模板中重复的核苷酸序列,导致 RNA 聚合酶停滞、离开 DNA 模板并释放 mRNA 转录本。

终止后,转录过程即告完成。 在原核细胞中,到终止时,转录本已经被用来部分合成大量编码蛋白质拷贝,因为这些过程可以使用多个核糖体(多核糖体)同时发生(图9.3.4)。 相比之下,真核细胞中存在细胞核就无法同时进行转录和翻译。

插图显示了从一个基因上转录了多个 mRNA。 核糖体在转录完成之前附着在 mRNA 上并开始制造蛋白质。
9.3.4多个聚合酶可以转录单个细菌基因,而许多核糖体同时将mRNA转录本转录为多肽。 通过这种方式,特定的蛋白质可以在细菌细胞中迅速达到高浓度。

真核生物 RNA 处理

新转录的真核生物 mRNA 必须经过多个处理步骤,然后才能从细胞核转移到细胞质并转化为蛋白质。 真核生物 mRNA 成熟所涉及的额外步骤会产生比原核生物 mRNA 稳定得多的分子。 例如,真核生物 mRNA 持续数小时,而典型的原核生物 mRNA 持续时间不超过五秒钟。

mRNA 转录本首先涂有 RNA 稳定蛋白,以防止其在处理和输出到细胞核外时降解。 这种情况发生在mRNA前仍在合成之中,方法是在生长转录本的5'末端添加一个特殊的核苷酸 “上限”。 除了防止降解外,蛋白质合成所涉及的因子还可以识别上限,以帮助启动核糖体的翻译。

伸长完成后,一种酶会在 3' 末端添加一串大约 200 个腺嘌呤残基,称为 Poly-A 尾巴。 这种修饰进一步保护 pre-mRNA 免受降解,并向细胞因子发出信号,表明转录本需要输出到细胞质中。

真核生物基因由称为外显子的蛋白质编码序列(e x- on 表示它们被压制)和称为内含子的 int ervening 序列(int- ron 表示它们的 int ervening 作用)组成。 在处理过程中,内含子会从前 mRNA 中移除。 mRNA 中的内含子序列不编码功能蛋白。 在蛋白质合成之前,必须完全、精确地去除所有 pre-mRNA 的内含子,以便外显子结合在一起编码正确的氨基酸。 如果这个过程出现了哪怕是单个核苷酸的错误,那么重新连接的外显子的序列就会发生转移,由此产生的蛋白质就会失效。 移除内含子和重新连接外显子的过程称为拼接(图9.3.5)。 当 pre-mRNA 仍在细胞核中时,内含子被移除并降解。

插图显示了具有三个外显子和两个内含子的初级 RNA 转录本。 在拼接的转录本中,内含子被移除,外显子融合在一起。 还添加了 5 英尺的帽子和 Poly-A 尾巴。
9.3.5真核生物 mRNA 含有必须拼接出的内含子。 还添加了5英尺的帽子和3英尺的尾巴。

摘要

在原核生物中,mRNA合成是从DNA模板上的启动子序列开始的。 伸长率合成了新的 mRNA。 终止会释放 mRNA,其发生机制会阻止 RNA 聚合酶并使其从 DNA 模板中脱落。 新转录的真核生物 mRNA 使用帽和 poly-A 尾巴进行修饰。 这些结构可保护成熟的 mRNA 免受降解,并有助于将其从细胞核中导出。 真核生物 mRNA 也经过拼接,其中内含子被移除,外显子以单核苷酸的准确性重新连接。 只有完成的 mRNA 才能从细胞核输出到细胞质。

词汇表

外显子
mRNA 前拼接完成后,蛋白质编码 mRNA 中存在一个序列
内含子
处理过程中从 mRNA 拼接的非蛋白质编码介入序列
mRNA
信使 RNA;一种携带翻译成多肽序列的蛋白质序列的核苷酸序列编码的 RNA
非模板链
不用于转录 mRNA 的 DNA 链;该链与 mRNA 相同,只是 DNA 中的 T 核苷酸被 mRNA 中的 U 核苷酸所取代
启动者
DNA 上的 DNA 序列,RNA 聚合酶和相关因子与之结合并启动转录
RNA 聚合酶
一种从 DNA 模板链合成 RNA 链的酶
粘接
在 mRNA 之前移除内含子和重新连接外显子的过程
模板链
指定互补 mRNA 分子的 DNA 链
转录气泡
允许转录 mRNA 的局部解开 DNA 区域