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4.4 : Bactéries à Gram positif

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    Objectifs d'apprentissage

    • Décrire les caractéristiques uniques de chaque catégorie de bactéries gram-positives à haut G+C et à faible G+C
    • Identifier les similitudes et les différences entre les groupes de bactéries à G+C élevé et à faible G+C
    • Donnez l'exemple d'une bactérie du groupe G+C élevé et faible G+C communément associée à chaque catégorie

    Les procaryotes sont identifiés comme gram-positifs s'ils possèdent une matrice multicouche de peptidoglycane formant la paroi cellulaire. Le violet cristallin, la coloration principale de la procédure de coloration de Gram, est facilement retenu et stabilisé dans cette matrice, ce qui donne aux procaryotes à Gram positif une apparence violette au microscope à fond clair après la coloration de Gram. Pendant de nombreuses années, la rétention de la coloration de Gram a été l'un des principaux critères utilisés pour classer les procaryotes, même si certains procaryotes ne se coloraient pas facilement avec les colorants primaires ou secondaires utilisés dans la procédure de coloration de Gram.

    Les progrès de la biochimie des acides nucléiques ont révélé des caractéristiques supplémentaires qui peuvent être utilisées pour classer les procaryotes à Gram positif, à savoir le rapport guanine/cytosine (G+C) dans l'ADN et la composition des sous-unités de l'ARNr 16S. Les microbiologistes reconnaissent actuellement deux groupes distincts de procaryotes gram-positifs ou faiblement colorés à Gram positif. La classe des actinobactéries comprend les bactéries gram-positives à haut niveau de G+C, qui ont plus de 50 % de nucléotides de guanine et de cytosine dans leur ADN. La classe des bacilles comprend les bactéries gram-positives à faible teneur en G+C, qui contiennent moins de 50 % de nucléotides de guanine et de cytosine dans leur ADN.

    Actinobactéries : bactéries à Gram positif à haute teneur en G+C

    Le nom Actinobacterium vient des mots grecs désignant les rayons et les petits bâtonnets, mais les actinobactéries sont très diverses. Leur apparence microscopique peut aller de fines tiges filamenteuses à des coccobacilles. Certaines actinobactéries sont très grandes et complexes, tandis que d'autres font partie des plus petits organismes vivants de façon autonome. La plupart des actinobactéries vivent dans le sol, mais certaines sont aquatiques. La grande majorité d'entre eux sont aérobies. Une caractéristique distinctive de ce groupe est la présence de plusieurs peptidoglycanes différents dans la paroi cellulaire.

    Le genre Actinomyces est un représentant très étudié des actinobactéries. Les Actinomyces spp. jouent un rôle important dans l'écologie des sols et certaines espèces sont des agents pathogènes pour l'homme. Un certain nombre d'Actinomyces spp. habitent la bouche humaine et sont des agents pathogènes opportunistes responsables de maladies infectieuses telles que la parodontite (inflammation des gencives) et les abcès buccaux. L'espèce A. israelii est un anaérobe connu pour provoquer une endocardite (inflammation de la paroi interne du cœur) (Figure\(\PageIndex{1}\)).

    a) Une micrographie de cellules ramifiées. B) Une micrographie de cellules disposées en forme de V — ce sont des palissades étiquetées. C) Une micrographie de cellules en forme de flocons de maïs dotées d'un noyau. Les cellules plus petites situées à l'extérieur de celles-ci sont identifiées par une flèche.
    Figure\(\PageIndex{1}\) : (a) Actinomyces israelii (micrographie électronique à balayage en fausses couleurs [MEB]) a une structure ramifiée. b) La corynebacterium diphtérie est à l'origine de la maladie mortelle que constitue la diphtérie. Remarquez les palissades distinctives. (c) La bactérie à Gram variable Gardnerella vaginalis provoque une vaginose bactérienne chez les femmes. Cette micrographie montre un test de Papanicolaou prélevé sur une femme atteinte de vaginose. (crédit a : modification du travail par « GrahamColm » /Wikimedia Commons ; crédit b : modification du travail par les Centers for Disease Control and Prevention ; crédit c : modification du travail par Mwakigonja AR, Torres LM, Mwakyoma HA, Kaaya EE)

    Le genre Mycobacterium est représenté par des bacilles recouverts d'une couche d'acide mycolique. Cette couche cireuse protège les bactéries de certains antibiotiques, les empêche de se dessécher et bloque la pénétration des réactifs de coloration de Gram (voir Coloration d'échantillons microscopiques). Pour cette raison, une procédure spéciale de coloration résistante aux acides est utilisée pour visualiser ces bactéries. Le genre Mycobacterium est une cause importante d'un groupe diversifié de maladies infectieuses. M. tuberculosis est l'agent causal de la tuberculose, une maladie qui touche principalement les poumons mais qui peut également infecter d'autres parties du corps. On estime qu'un tiers de la population mondiale a été infectée par M. tuberculosis et que des millions de nouvelles infections surviennent chaque année. Le traitement de M. tuberculosis est difficile et oblige les patients à prendre une combinaison de médicaments pendant une période prolongée. Le développement et la propagation de souches multirésistantes de ce pathogène compliquent encore davantage le traitement.

    Une autre espèce pathogène, M. leprae, est à l'origine de la maladie de Hansen (lèpre), une maladie chronique qui affecte les nerfs périphériques et l'intégrité de la peau et de la surface des muqueuses des voies respiratoires. La perte de la sensation de douleur et la présence de lésions cutanées augmentent la vulnérabilité aux blessures secondaires et aux infections par d'autres agents pathogènes.

    Les bactéries du genre Corynebacterium contiennent de l'acide diaminopimélique dans leurs parois cellulaires et forment souvent au microscope des palissades, ou des paires de cellules en forme de bâtonnets ressemblant à la lettre V. Les cellules peuvent contenir des granules métachromatiques, un stockage intracellulaire de phosphates inorganiques utiles pour l'identification de Corynebacterium. La grande majorité des Corynebacterium spp. ne sont pas pathogènes ; toutefois, C. diphtérie est l'agent causal de la diphtérie, une maladie qui peut être fatale, en particulier chez les enfants (Figure\(\PageIndex{1}\)). C. diphtérie produit une toxine qui forme une pseudomembrane dans la gorge du patient, provoquant un gonflement, des difficultés respiratoires et d'autres symptômes qui peuvent devenir graves s'ils ne sont pas traités.

    Le genre Bifidobacterium comprend des anaérobies filamenteux, dont beaucoup se trouvent couramment dans le tractus gastro-intestinal, le vagin et la bouche. En fait, les Bifidobacterium spp. constituent une partie importante du microbiote intestinal humain et sont fréquemment utilisés comme probiotiques et dans la production de yaourts.

    Le genre Gardnerella ne contient qu'une seule espèce, G. vaginalis. Cette espèce est définie comme « gram-variable » parce que ses petits coccobacilles ne donnent pas de résultats cohérents lorsqu'ils sont colorés à Gram (Figure\(\PageIndex{1}\)). Sur la base de son génome, il est placé dans le groupe à Gram positif élevé en G+C. G. vaginalis peut provoquer une vaginose bactérienne chez la femme ; les symptômes sont généralement légers, voire indétectables, mais peuvent entraîner des complications pendant la grossesse.

    \(\PageIndex{1}\)Le tableau résume les caractéristiques de certains genres importants d'actinobactéries.

    Tableau\(\PageIndex{1}\) : Actinobactéries : G+C Gram positif élevé
    Exemple de genre Morphologie microscopique Caractéristiques uniques
    Actinomyces Bacille à Gram positif ; en colonies, présente des fils ressemblant à des champignons (hyphes) Anaérobies facultatifs ; dans le sol, décompose la matière organique ; dans la bouche humaine, peut provoquer des maladies des gencives
    Arthrobacter Bacille à Gram positif (au stade exponentiel de croissance) ou coccus (en phase stationnaire) Obliger les aérobies ; diviser en « cassant », formant des paires de cellules filles en forme de V ; dégrader le phénol, peut être utilisé en bioremédiation
    Bifidobacterium Actinobactérie filamenteuse à Gram positif Anaérobies couramment présents dans le microbiote intestinal humain
    Corynebacterium Bacille à Gram positif Aérobies ou anaérobies facultatifs ; forment des palissades ; se développent lentement ; nécessitent un milieu de culture enrichi ; C. diphtheriae provoque la diphtérie
    Frankia Bacille à Gram positif ressemblant à un champignon (filamenteux) Bactéries fixatrices d'azote ; vivent en symbiose avec les légumineuses
    Gardnerella Coccobacilles à Gram variable Coloniser le vagin humain, peut altérer l'écologie microbienne, entraînant ainsi une vaginose
    Microcoque Cocque à Gram positif, forme des amas microscopiques Omniprésent dans l'environnement et sur la peau humaine ; oxydase positive (par opposition à S. aureus morphologiquement similaire) ; certains sont des agents pathogènes opportunistes
    Mycobactérie Bacille à Gram positif résistant à l'acide À croissance lente, aérobie, résistant au dessèchement et à la phagocytose ; recouvert d'une couche cireuse faite d'acide mycolique ; M. tuberculosis cause la tuberculose ; M. leprae cause la lèpre
    Nocardia Bacille à Gram positif faible ; forme des branches résistantes à l'acide Peut coloniser la gencive humaine ; peut provoquer une pneumonie grave et une inflammation de la peau
    Propionibactérie Bacille à Gram positif Anaérotolérant anaérobie ; croissance lente ; P. acnes se reproduit dans les glandes sébacées humaines et peut provoquer l'acné ou y contribuer
    Rhodocoque Bacille à Gram positif Aérobe strict ; utilisé dans l'industrie pour la biodégradation des polluants ; R. fascians est un phytopathogène et R. equi cause une pneumonie chez les poulains
    Streptomyces Bacille à Gram positif ressemblant à un champignon (filamenteux) Genre très diversifié (> 500 espèces) ; bactéries aérobies formant des spores ; charognards, décomposeurs présents dans le sol (qui donnent au sol son odeur « terreuse ») ; utilisés dans l'industrie pharmaceutique comme producteurs d'antibiotiques (plus des deux tiers des antibiotiques cliniquement utiles)

    Exercice\(\PageIndex{1}\)

    Quelle est la particularité des actinobactéries ?

    Bactéries à Gram positif à faible G+C

    Les bactéries gram-positives à faible teneur en G+C contiennent moins de 50 % de guanine et de cytosine dans leur ADN, et ce groupe de bactéries comprend un certain nombre de genres de bactéries pathogènes.

    Orientation clinique : 3e partie

    Sur la base de ses symptômes, le médecin de Marsha a soupçonné qu'elle avait un cas de tuberculose. Bien que moins répandue aux États-Unis, la tuberculose reste extrêmement courante dans de nombreuses régions du monde, y compris au Nigéria. Le travail de Marsha dans un laboratoire médical l'a probablement exposée à Mycobacterium tuberculosis, la bactérie responsable de la tuberculose.

    Le médecin de Marsha lui a ordonné de rester chez elle, de porter un masque respiratoire et de se confiner dans une seule pièce autant que possible. Il a également déclaré que Marsha avait dû s'absenter de l'école pendant un semestre. Il a prescrit de l'isoniazide et de la rifampicine, des antibiotiques utilisés dans un cocktail de médicaments pour traiter la tuberculose, que Marsha devait prendre trois fois par jour pendant au moins trois mois.

    Exercice\(\PageIndex{2}\)

    Pourquoi le médecin a-t-il ordonné à Marsha de rester à la maison pendant trois mois ?

    Clostridie

    Les Clostridia constituent une classe importante et diversifiée de bactéries gram-positives à faible teneur en G+C. Le genre le mieux étudié de cette classe est Clostridium. Ces bactéries en forme de bâtonnets sont généralement des anaérobies obligatoires qui produisent des endospores et peuvent être trouvées dans des habitats anaérobies tels que le sol et les sédiments aquatiques riches en nutriments organiques. Les endospores peuvent survivre pendant de nombreuses années.

    Les Clostridium spp. produisent plus de types de toxines protéiques que tout autre genre bactérien, et plusieurs espèces sont des agents pathogènes pour l'homme. C. perfringens est la troisième cause la plus fréquente d'intoxication alimentaire aux États-Unis et est l'agent causal d'une maladie encore plus grave appelée gangrène gazeuse. La gangrène gazeuse se produit lorsque les endospores de C. perfringens pénètrent dans une plaie et germent, devenant des cellules bactériennes viables et produisant une toxine qui peut provoquer la nécrose (mort) des tissus. C. tetani, responsable du tétanos, produit une neurotoxine capable de pénétrer dans les neurones, de se déplacer vers des régions du système nerveux central où elle bloque l'inhibition de l'influx nerveux impliqué dans les contractions musculaires et de provoquer une paralysie spastique potentiellement mortelle. C. botulinum produit de la neurotoxine botulique, la toxine biologique la plus létale connue. La toxine botulique est responsable de cas rares mais souvent mortels de botulisme. La toxine bloque la libération d'acétylcholine dans les jonctions neuromusculaires, provoquant une paralysie flasque. À de très faibles concentrations, la toxine botulique a été utilisée pour traiter les pathologies musculaires chez l'homme et dans le cadre d'une procédure cosmétique visant à éliminer les rides. C. difficile est une source courante d'infections nosocomiales (Figure\(\PageIndex{2}\)) qui peuvent entraîner des cas graves, voire mortels, de colite (inflammation du gros intestin). Les infections surviennent souvent chez des patients immunodéprimés ou sous antibiothérapie qui altèrent le microbiote normal du tractus gastro-intestinal.

    Une micrographie de nombreuses cellules en forme de bâtonnets.
    Figure\(\PageIndex{2}\) : Clostridium difficile, une bactérie gram-positive en forme de bâtonnet, provoque de graves colites et diarrhées, souvent après l'éradication du microbiote intestinal normal par des antibiotiques. (source : modification des travaux des Centres pour le contrôle et la prévention des maladies)

    Lactobacilles

    L'ordre des Lactobacillales comprend des bactéries gram-positives à faible teneur en G+C qui incluent à la fois des bacilles et des cocci des genres Lactobacillus, Leuconostoc, Enterococcus et Streptococcus. Les bactéries des trois derniers genres sont généralement sphériques ou ovoïdes et forment souvent des chaînes.

    Le streptocoque, dont le nom vient du mot grec pour chaîne tordue, est responsable de nombreux types de maladies infectieuses chez l'homme. Les espèces de ce genre, souvent appelées streptocoques, sont généralement classées selon des sérotypes appelés groupes de Lancefield et selon leur capacité à lyser les globules rouges lorsqu'elles sont cultivées sur de la gélose sanguine.

    S. pyogenes appartient au groupe A de Lancefield, le streptocoque β-hémolytique. Cette espèce est considérée comme un agent pathogène pyogène en raison de la production de pus associée observée lors des infections qu'elle provoque (Figure\(\PageIndex{3}\)). S. pyogenes est la cause la plus fréquente de pharyngite bactérienne (angine streptococcique) ; elle est également une cause importante de diverses infections cutanées qui peuvent être relativement légères (par exemple, l'impétigo) ou potentiellement mortelles (par exemple, fasciite nécrosante, également appelée maladie mangeuse de chair), voire mortelles.

    a) Une micrographie des cellules sphériques d'une chaîne. B) Une photographie de colonies sur gélose. La gélose est rouge et il y a une clairière autour de chaque colonie.
    Figure\(\PageIndex{3}\) : (a) Un spécimen de Streptococcus pyogenes coloré au gramme montre les chaînes de cocci caractéristiques de la morphologie de cet organisme. (b) Sur gélose au sang, S. pyogenes présente une lyse caractéristique des globules rouges, indiquée par le halo de clairière qui entoure les colonies. (crédit a, b : modification des travaux de l'American Society for Microbiology)

    Les streptocoques non pyogènes (c'est-à-dire non associés à la production de pus) sont un groupe d'espèces streptococciques qui ne constituent pas un taxon mais qui sont regroupées parce qu'elles habitent la bouche humaine. Les streptocoques non pyogènes n'appartiennent à aucun des groupes de Lancefield. La plupart sont commensales, mais quelques-unes, comme S. mutans, sont impliquées dans le développement de la carie dentaire.

    S. pneumoniae (communément appelée pneumocoque) est une espèce de streptocoque qui n'appartient pas non plus à aucun groupe de Lancefield. Les cellules de S. pneumoniae apparaissent au microscope sous forme de diplocoques, c'est-à-dire de paires de cellules, plutôt que de longues chaînes typiques de la plupart des streptocoques. Les scientifiques savent depuis le XIXe siècle que S. pneumoniae provoque des pneumonies et d'autres infections respiratoires. Cependant, cette bactérie peut également provoquer un large éventail d'autres maladies, notamment la méningite, la septicémie, l'ostéomyélite et l'endocardite, en particulier chez les nouveau-nés, les personnes âgées et les patients immunodéficients.

    Bacilles

    Le nom de la classe Bacilli suggère qu'elle est composée de bactéries de forme bacillaire, mais il s'agit d'une classe morphologiquement diversifiée qui comprend des genres en forme de bacille et en forme de coccus. Parmi les nombreux genres de cette classe, il y en a deux qui sont très importants sur le plan clinique : Bacillus et Staphylococcus.

    Les bactéries du genre Bacillus ont la forme d'un bacille et peuvent produire des endospores. Il s'agit notamment des aérobies ou des anaérobies facultatifs. Un certain nombre de Bacillus spp. sont utilisés dans diverses industries, notamment pour la production d'antibiotiques (par exemple, la barnase), d'enzymes (par exemple, l'alpha-amylase, l'endonucléase de restriction BamH1) et de détergents (par exemple, la subtilisine).

    Deux agents pathogènes notables appartiennent au genre Bacillus. B. anthracis est l'agent pathogène responsable de l'anthrax, une maladie grave qui touche les animaux sauvages et domestiques et qui peut se transmettre des animaux infectés aux humains. L'anthrax se manifeste chez l'homme par des ulcères noirs sur la peau, une entérocolite sévère, une pneumonie et des lésions cérébrales dues à un gonflement. S'il n'est pas traité, l'anthrax est mortel. B. cereus, une espèce étroitement apparentée, est un agent pathogène qui peut provoquer des intoxications alimentaires. C'est une espèce en forme de bâtonnet qui forme des chaînes. Les colonies apparaissent d'un blanc laiteux avec des formes irrégulières lorsqu'elles sont cultivées sur gélose au sang (Figure\(\PageIndex{4}\)). Une autre espèce importante est B. thuringiensis. Cette bactérie produit un certain nombre de substances utilisées comme insecticides car elles sont toxiques pour les insectes.

    a) Une micrographie de cellules en forme de bâtonnet formant une chaîne. B) Une photographie de colonies sur gélose. La gélose est rouge et les colonies sont blanches et d'apparence duveteuse.
    Figure\(\PageIndex{4}\) : (a) Dans cet échantillon coloré au gramme, les cellules violettes en forme de bâtonnets formant des chaînes sont la bactérie Gram positif Bacillus cereus. Les petites cellules roses sont la bactérie gram-négative Escherichia coli. (b) Dans cette culture, des colonies blanches de B. cereus ont été cultivées sur de la gélose au sang de mouton. (crédit a : modification du travail par « Bibliomaniac 15 » /Wikimedia Commons ; crédit b : modification du travail par les Centers for Disease Control and Prevention)

    Le genre Staphylococcus appartient également à la classe des bacilles, bien que sa forme soit celle d'un coccus plutôt que d'un bacille. Le nom Staphylococcus vient d'un mot grec désignant les grappes de raisins, qui décrit leur aspect microscopique en culture (Figure\(\PageIndex{5}\)). Les Staphylococcus spp. sont anaérobies, halophiles et non mobiles facultatifs. Les deux espèces les plus étudiées de ce genre sont S. epidermidis et S. aureus.

    Une micrographie d'amas de cellules sphériques.
    Figure\(\PageIndex{5}\) : Cette SEM de Staphylococcus aureus illustre le regroupement cellulaire typique « semblable à un raisin ». (source : modification des travaux des Centres pour le contrôle et la prévention des maladies)

    S. epidermidis, dont l'habitat principal est la peau humaine, est considéré comme non pathogène pour les humains dont le système immunitaire est en bonne santé, mais chez les patients immunodéficients, il peut provoquer des infections des plaies cutanées et des prothèses (par exemple, articulations artificielles, valves cardiaques). S. epidermidis est également une cause importante d'infections associées aux cathéters intraveineux. Cela en fait un agent pathogène dangereux en milieu hospitalier, où de nombreux patients peuvent être immunodéprimés.

    Les souches de S. aureus provoquent une grande variété d'infections chez les humains, y compris des infections cutanées qui provoquent des furoncles, des anthrax, de la cellulite ou de l'impétigo. Certaines souches de S. aureus produisent une substance appelée entérotoxine, qui peut provoquer une entérite grave, souvent appelée intoxication alimentaire par staphylocoque. Certaines souches de S. aureus produisent la toxine responsable du syndrome de choc toxique, qui peut entraîner un collapsus cardiovasculaire et la mort.

    De nombreuses souches de S. aureus ont développé une résistance aux antibiotiques. Certaines souches résistantes aux antibiotiques sont désignées comme des souches de S. aureus résistantes à la méthicilline (SARM) et de S. aureus résistantes à la vancomycine (VRSA). Ces souches sont parmi les plus difficiles à traiter car elles sont résistantes à presque tous les antibiotiques disponibles, et pas seulement à la méthicilline et à la vancomycine. Comme elles sont difficiles à traiter avec des antibiotiques, les infections peuvent être mortelles. Le SARM et le VRSA sont également contagieux et constituent une grave menace dans les hôpitaux, les maisons de retraite, les centres de dialyse et autres lieux où se trouvent d'importantes populations de personnes âgées, alitées et/ou immunodéprimées.

    Mycoplasmes

    Bien que les Mycoplasma spp. ne possèdent pas de paroi cellulaire et ne soient donc pas colorés par les réactifs de coloration à Gram, ce genre fait toujours partie des bactéries gram-positives à faible teneur en G+C. Le genre Mycoplasma comprend plus de 100 espèces qui partagent plusieurs caractéristiques uniques. Ce sont de très petites cellules, dont certaines ont un diamètre d'environ 0,2 μm, ce qui est plus petit que celui de certains grands virus. Elles n'ont pas de parois cellulaires et sont donc pléomorphes, ce qui signifie qu'elles peuvent prendre diverses formes et même ressembler à de très petites cellules animales. Comme ils n'ont pas de forme caractéristique, ils peuvent être difficiles à identifier. Une espèce, M. pneumoniae, est à l'origine de la forme bénigne de pneumonie appelée « pneumonie ambulante » ou « pneumonie atypique ». Cette forme de pneumonie est généralement moins grave que les formes causées par d'autres bactéries ou virus.

    \(\PageIndex{2}\)Le tableau résume les caractéristiques des genres notables de bactéries Gram positives à faible teneur en G+C. Tableau\(\PageIndex{2}\) : Bacilles - Bactéries à Gram positif à faible teneur en G+C
    Exemple de genre Morphologie microscopique Caractéristiques uniques
    Bacille Grand bacille à Gram positif Aérobies ou anaérobies facultatifs ; forment des endospores ; B. anthracis provoque l'anthrax chez les bovins et les humains, B. cereus peut provoquer une intoxication alimentaire
    Clostridium Bacille à Gram positif Anaérobies stricts ; forment des endospores ; toutes les espèces connues sont pathogènes et provoquent le tétanos, la gangrène gazeuse, le botulisme et la colite
    Entérocoque Cocque à Gram positif ; forme des paires microscopiques en culture (ressemblant à Streptococcus pneumoniae) Les bactéries aérotolérantes anaérobies, abondantes dans l'intestin humain, peuvent provoquer des infections des voies urinaires et d'autres infections de l'environnement nosocomial
    Lactobacille Bacille à Gram positif Anaérobies facultatifs ; fermentent les sucres en acide lactique ; font partie du microbiote vaginal ; utilisés comme probiotiques
    Leuconostoc Cocque à Gram positif ; peut former des chaînes microscopiques en culture Fermenteur, utilisé dans l'industrie alimentaire pour produire de la choucroute et du kéfir
    Mycoplasme Les plus petites bactéries apparaissent pléomorphes au microscope électronique N'ont pas de paroi cellulaire ; sont classées dans la catégorie des bactéries Gram positives à faible teneur en G+C en raison de leur génome ; M. pneumoniae provoque une pneumonie « ambulante »
    Staphylocoque Cocque à Gram positif ; forme des grappes microscopiques en culture qui ressemblent à des grappes de raisin Tolère une forte concentration de sel ; des anaérobies facultatifs ; produit de la catalase ; S. aureus peut également produire de la coagulase et des toxines responsables d'infections locales (cutanées) et généralisées
    Streptocoque Cocque à Gram positif ; forme des chaînes ou des paires en culture Genre diversifié ; classé en groupes en fonction du partage de certains antigènes ; certaines espèces provoquent une hémolyse et peuvent produire des toxines responsables de maladies locales (gorge) et généralisées chez l'homme
    Ureaplasma Semblable à Mycoplasma Partie du microbiote du vagin et des voies urinaires inférieures de l'homme ; peut provoquer une inflammation, parfois des cicatrices internes et une infertilité

    Exercice\(\PageIndex{3}\)

    1. Nommez certaines méthodes de classification des streptocoques.
    2. Nommez une bactérie pathogène à faible teneur en G+C à Gram positif et la maladie qu'elle cause.

    Orientation clinique : résolution

    L'échantillon de crachats de Marsha a été envoyé au laboratoire de microbiologie pour confirmer l'identité du microorganisme à l'origine de son infection. Le laboratoire a également effectué des tests de sensibilité aux antimicrobiens (AST) sur l'échantillon pour confirmer que le médecin avait prescrit les bons médicaments antimicrobiens.

    L'examen microscopique direct des expectorations a révélé la présence de bactéries acido-résistantes (AFB) dans les expectorations de Marsha. Lors de la mise en culture, aucun signe de croissance n'a été observé pendant les 8 premiers jours, ce qui suggère que le microorganisme était mort ou qu'il se développait très lentement. La croissance lente est une caractéristique distinctive de M. tuberculosis.

    Après quatre semaines, le microbiologiste de laboratoire a observé des colonies granulées incolores distinctives (Figure\(\PageIndex{6}\)). Les colonies contenaient une AFB présentant les mêmes caractéristiques microscopiques que celles révélées lors de l'examen microscopique direct des expectorations de Marsha. Pour confirmer l'identification de l'AFB, des échantillons des colonies ont été analysés par hybridation des acides nucléiques ou par amplification directe des acides nucléiques (NAA). Lorsqu'une bactérie est résistante aux acides, elle est classée dans la famille des Mycobactériacées. Le séquençage de l'ADN de régions génomiques variables de l'ADN extrait de ces bactéries a révélé un taux élevé de G+C, ce qui a permis de finaliser le diagnostic de Marsha comme étant une infection par M. tuberculosis. Après neuf mois de traitement avec les médicaments prescrits par son médecin, Marsha s'est complètement rétablie.

    Une photographie de colonies sur gélose. La gélose est bleue et les colonies ressemblent à un tas de perles.
    Figure\(\PageIndex{6}\) : M. tuberculosis pousse sur de la gélose Löwenstein-Jensen (LJ) en colonies distinctes. (source : Centres pour le contrôle et la prévention des maladies)

    Biopiraterie et bioprospection

    En 1969, un employé d'une société pharmaceutique suisse était en vacances en Norvège et a décidé de prélever des échantillons de sol. Il les a ramenés à son laboratoire, et la société suisse a ensuite utilisé le champignon Tolypocladium inflatum dans ces échantillons pour développer la cyclosporine A, un médicament largement utilisé chez les patients qui subissent une transplantation de tissus ou d'organes. L'entreprise suisse gagne plus d'un milliard de dollars par an pour la production de cyclosporine A, mais la Norvège ne reçoit rien en retour : aucun paiement au gouvernement ni avantage pour le peuple norvégien. Bien que la cyclosporine A sauve de nombreuses vies, nombreux sont ceux qui considèrent le moyen par lequel les échantillons de sol ont été prélevés comme un acte de « biopiraterie », essentiellement une forme de vol. La fin justifie-t-elle les moyens dans un cas comme celui-ci ?

    La nature regorge de bactéries et d'autres microorganismes encore inconnus qui pourraient un jour être utilisés pour développer de nouveaux médicaments ou traitements susceptibles de sauver des vies. 1 Les entreprises pharmaceutiques et biotechnologiques peuvent tirer d'énormes profits de ces découvertes, mais des questions éthiques demeurent. À qui appartiennent les ressources biologiques ? Les entreprises qui investissent (et risquent) des millions de dollars dans la recherche et le développement devraient-elles être obligées de partager les revenus ou les redevances pour le droit d'accès aux ressources biologiques ?

    La compensation n'est pas le seul problème en matière de bioprospection. Certaines communautés et cultures s'opposent philosophiquement à la bioprospection, craignant les conséquences imprévues de la collecte de matériel génétique ou biologique. Les Hawaïens natifs, par exemple, sont très protecteurs de leurs ressources biologiques uniques.

    Pendant de nombreuses années, les droits des agences gouvernementales, des entreprises privées et des citoyens en matière de collecte d'échantillons de microorganismes sur des terres publiques n'étaient pas clairs. Puis, en 1993, la Convention sur la diversité biologique a accordé à chaque nation les droits sur tout matériel génétique et biologique trouvé sur ses propres terres. Les scientifiques ne peuvent plus prélever des échantillons sans un accord préalable avec le propriétaire foncier pour obtenir une indemnisation. Cette convention garantit désormais que les entreprises agissent de manière éthique lorsqu'elles obtiennent les échantillons qu'elles utilisent pour créer leurs produits.

    Résumé

    • Les bactéries à Gram positif constituent un groupe très important et diversifié de microorganismes. Il est important de comprendre leur taxonomie et de connaître leurs caractéristiques uniques pour le diagnostic et le traitement des maladies infectieuses.
    • Les bactéries à Gram positif sont classées en bactéries grampositives à haute teneur en G+C et en bactéries grampositives à faible teneur en G+C, en fonction de la prévalence des nucléotides de guanine et de cytosine dans leur génome
    • Les actinobactéries sont le nom taxonomique de la classe des bactéries gram-positives à haut G+C. Cette classe comprend les genres Actinomyces, Arthrobacter, Corynebacterium, Frankia, Gardnerella, Micrococcus, Mycobacterium, Nocardia, Propionibacterium, Rhodococcus et Streptomyces. Certains représentants de ces genres sont utilisés dans l'industrie ; d'autres sont des agents pathogènes pour les humains ou les animaux.
    • Parmi les bactéries gram-positives à haute teneur en G+C qui sont des agents pathogènes humains, citons Mycobacterium tuberculosis, qui cause la tuberculose ; M. leprae, qui cause la lèpre (maladie de Hansen) ; et Corynebacterium diphtheriae, qui cause la diphtérie.
    • Les Clostridia spp. sont des bactéries gram-positives à faible teneur en G+C qui sont généralement des anaérobies obligatoires et peuvent former des endospores. Les agents pathogènes de ce genre incluent C. perfringens (gangrène gazeuse), C. tetani (tétanos) et C. botulinum (botulisme).
    • Les lactobacillales comprennent les genres Enterococcus, Lactobacillus, Leuconostoc et Streptococcus. Le streptocoque est responsable de nombreuses maladies humaines, notamment la pharyngite (angine streptococcique), la scarlatine, le rhumatisme articulaire aigu, la glomérulonéphrite, la pneumonie et d'autres infections respiratoires.
    • Les bacilles sont une classe taxonomique de bactéries gram-positives à faible teneur en G+C qui comprend des espèces en forme de bâtonnets et de coccus, y compris les genres Bacillus et Staphylococcus. B. anthracis provoque l'anthrax, B. cereus peut provoquer des infections opportunistes du tractus gastro-intestinal et les souches de S. aureus peuvent provoquer un large éventail d'infections et de maladies, dont beaucoup sont très résistantes aux antibiotiques.
    • Les Mycoplasma spp. sont de très petites bactéries pléomorphes à faible teneur en G+C à Gram positif qui sont dépourvues de parois cellulaires. M. pneumoniae provoque une pneumonie atypique.

    Notes

    1. 1 J. André. La bioéthique en tant que pratique. Chapel Hill, Caroline du Nord : Presse de l'Université de Caroline du Nord, 2002.