D: تصنيف الكائنات الحية الدقيقة ذات الصلة سريريًا
- Page ID
- 195126
مسببات الأمراض البكتيرية
تسرد الجداول التالية الأنواع وبعض المجموعات العليا من البكتيريا المسببة للأمراض المذكورة في النص. تصنيف البكتيريا، أحد مجالات الحياة الثلاثة، في حالة تغير مستمر حيث تصبح العلاقات أكثر وضوحًا من خلال أخذ عينات من التسلسلات الجينية. لا تزال العديد من المجموعات على جميع المستويات التصنيفية لديها علاقة غير محددة مع الأعضاء الآخرين في شجرة النشوء والتطور للبكتيريا. يحتفظ دليل Bergey لمنهجية الأركيا والبكتيريا بقائمة وأوصاف منشورة للأنواع بدائية النواة. تتبع الجداول هنا التنظيم التصنيفي في المخطط التصنيفي اليدوي لـ Bergey. 1
لقد قسمنا الأنواع إلى جداول تتوافق مع أنواع البكتيريا المختلفة. لا يتم استخدام الترتيب التصنيفي للمملكة في تصنيف بدائيات النواة، لذا فإن الفيلا هي المجموعة الفرعية أسفل المجال. لاحظ أن العديد من أنواع البكتيريا لا تمثلها هذه الجداول. يتم سرد الأنواع والأجناس فقط ضمن الفئة داخل كل شريحة. يتم تنظيم الأسماء المعطاة للبكتيريا من خلال المدونة الدولية لتسميات البكتيريا كما تحتفظ بها اللجنة الدولية للنظاميات أو بدائيات النواة.
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
بكتيريا الأكتينوباكتيريا | كورينيباكتريوم | خناق | الدفتيريا |
الغاردنريلة | المهبل | التهاب المهبل البكتيري | |
ميكروكوكوس | العدوى الانتهازية | ||
المتفطرة | بوفيس | مرض السل، وخاصة في الماشية | |
المتفطرة | الجذام | مرض هانسن | |
المتفطرة | مرض السل | مرض السل | |
بروبيونيباكتريوم | حب الشباب | حب الشباب، التهاب الجفن، التهاب باطن المقلة |
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
باكتيريوديا | البورفيروموناس | أمراض اللثة | |
بريفوتيلا | وسائل الإعلام | أمراض اللثة |
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
الكلاميديا | مرض الكلاميديا | بستاتي | داء الببغائية |
مرض الكلاميديا | التراخوماتيس | الكلاميديا المنقولة جنسياً |
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
عصيات | عصيات | أنثراسيس | الجمرة |
عصيات | سيريوس | الإسهال والتسمم الغذائي المقيئ | |
الليستيريا | المونوسيتوجينات | داء الليستريات | |
المكورات المعوية | البرازي | التهاب الشغاف، تسمم الدم، التهابات المسالك البولية، التهاب السحايا | |
المكورات العنقودية | أوريوس | التهابات الجلد والتهاب الجيوب الأنفية والتسمم الغذائي | |
المكورات العنقودية | البشرة | العدوى المستشفوية والانتهازية | |
المكورات العنقودية | أشباه البشر | العدوى الانتهازية | |
المكورات العنقودية | نبتة سابروفيكوس | التهابات المسالك البولية | |
المكورات العقدية | غالاكتييا | عدوى ما بعد الولادة والإنتان الوليدي | |
المكورات العقدية | الطافرة | تسوس الأسنان | |
المكورات العقدية | الرئة | الالتهاب الرئوي والعديد من الإصابات الأخرى | |
المكورات العقدية | الجينات المقيحة | التهاب البلعوم، الحمى القرمزية، القوباء، التهاب اللفافة الناخر | |
كلوستريديا | كلوستريديوم | البوتولينيوم | تسمم البوتولينوم |
كلوستريديوم | العسيرة | التهاب القولون | |
كلوستريديوم | المنحرفين | التسمم الغذائي والغرغرينا الغازية | |
كلوستريديوم | تيتاني | الكزاز |
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
فوسوباكتيريا | فوسوباكتريوم | أمراض اللثة، متلازمة ليمير، تقرحات الجلد | |
ستريبتوباسيلوس | مونيليفورميس | حمى لدغة الفئران |
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
بكتيريا ألفا بروتينية | أنابلاسما | بلعمية | أنابلاسما حبيبية بشرية |
بارتونيلا | الهرسانات | التهاب الكبد، التهاب الكبد، الورم الوعائي العصوي، التهاب الشغاف، تجرثم الدم. | |
بارتونيلا | كوينتانا | حمى الخندق | |
بروسيلا | ميليتينسيس | داء البروسيلات الغروية | |
إرليشيا | شافينسيس | داء الإيرليخ الأحادي البشري | |
الريكتسيا | بروفازكي | التيفوس الوبائي | |
الريكتسيا | الريكيتسي | رصدت حمى روكي ماونتن | |
الريكتسيا | الحمى التيفية | التيفوس الجرثومي | |
بكتيريا بيتا بروتينية | بورديتيلا | السعال الديكي | السعال الديكي |
إيكينيلا | عدوى إصابات العضة | ||
النيسرية | مرض السيلان | مرض السيلان | |
النيسرية | التهاب السحايا | التهاب السحايا | |
سبيريلوم | ناقص (بديل ثانوي) | سودوكو (حمى لدغة الفئران) | |
بكتيريا إبسيلون البروتيوباكتيريا | كامبيلوباكتر | جيجوني | التهاب المعدة والأمعاء، متلازمة غيلان باريه |
هيليكوباكتر | بيلوري | قرحة المعدة | |
بكتيريا جاما بروتينية | أيروموناس | هدروفيلا | التهاب المعدة والأمعاء الزحاري |
كوكسيلا | بورنيتى | حمى كيو | |
إنتيروباكتر | التهابات الجهاز البولي والجهاز التنفسي | ||
الشريكية | سلالات القولونية: المنتجة لتوكسين شيغا (STEC) (على سبيل المثال، O157: H7) وتسمى أيضًا الإشريكية القولونية النزفية المعوية (EHEC) أو E. coli المنتجة للفيروسيتوتوكسين (VTEC) |
تفشي الإسهال المنقول بالغذاء، التهاب القولون النزفي، متلازمة انحلال الدم اليوريمي | |
الشريكية | سلالة القولونية: الإشريكية القولونية المعوية (ETEC) |
إسهال المسافر | |
الشريكية | سلالة القولونية: بكتيريا E. coli المسببة للأمراض المعوية (EPEC) |
الإسهال، خاصة عند الأطفال الصغار | |
الشريكية | سلالة القولونية : بكتيريا الإشريكية القولونية (EAEC) |
مرض الإسهال لدى الأطفال والمسافرين | |
الشريكية | سلالة القولونية: ملتصقة بشكل منتشر E. coli (DAEC) |
مرض الإسهال لدى الأطفال | |
الشريكية | سلالة القولونية: الإشريكية القولونية المعوية (EPEC) |
الزحار العصوي، تغزو الخلايا الخلايا الظهارية المعوية | |
فرانسيسيلا | تولارينسيس | تولاريميا | |
هيموفيلوس | دوكري | شانكرويد | |
هيموفيلوس | الأنفلونزا | تجرثم الدم والالتهاب الرئوي والتهاب السحايا | |
كليبسيلا | الرئة | الالتهاب الرئوي والتهابات المستشفيات | |
الليجيونيلا | التهاب رئوي | مرض الفيالقة | |
موراكسيلا | نزلات البرد | التهاب الأذن الوسطى والتهاب الشعب الهوائية والتهاب الجيوب الأنفية والتهاب الحنجرة والالتهاب الرئوي | |
باستوريلا | الباستوريلوسيس | ||
بليسيوموناس | شيجيلواديس | التهاب المعدة والأمعاء | |
بروتيوس | التهابات المسالك البولية الانتهازية | ||
الزائفة | الزنجارية | الالتهاب الرئوي الانتهازي والمستشفى والإنتان | |
السالموني | بونغوري | داء السلمونيلات | |
السالموني | إنتيريكا | داء السلمونيلات | |
سيراتيا | الالتهاب الرئوي والتهابات المسالك البولية | ||
الشيغيلا | بويدي | الزحار | |
الشيغيلا | الزحار | الزحار | |
الشيغيلا | فليكسنيري | الزحار | |
الشيغيلا | سونّي | الزحار | |
فيبريو | كوليرا | كوليرا | |
فيبريو | باراهيموليتيكوس | التهاب المعدة والأمعاء للمأكولات البحرية | |
فيبريو | التهاب الفرج | التهاب المعدة والأمعاء للمأكولات البحرية، والتهابات الجروح الناخرية، وتسمم الدم | |
يرسينيا | إنتيروكوليتيكا | داء اليرسينيوسيس | |
يرسينيا | بيستيس | الطاعون | |
يرسينيا | مرض السل الكاذب | حمى تشبه الحمى القرمزية في الشرق الأقصى |
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
سبيروشايتيا | بوريليا | بورغدورفيري | مرض لايم |
بوريليا | هيرمسي | حمى انتكاسية تنقلها القراد | |
بوريليا | التهاب متكرر | الحمى الراجعة التي تنقلها القملة | |
ليبتوسبيرا | الاستجوابات | داء ليبتوسبيروسيس | |
تريبونيما | الشاحبة | مرض الزهري، النجيل، البونتا، الداء العليقي |
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
موليكات | الميكوبلازما | الأعضاء التناسلية | التهاب الإحليل، التهاب عنق الرحم |
الميكوبلازما | أشباه البشر | مرض التهاب الحوض، التهاب المهبل البكتيري | |
الميكوبلازما | الرئة | الالتهاب الرئوي الميكوبلازما | |
أوريابلاسما | أورياليتيكوم | التهاب الإحليل، الالتهابات الجنينية |
مسببات الأمراض الفيروسية
هناك العديد من أنظمة التصنيف للفيروسات. اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV) هي الهيئة العلمية الدولية المسؤولة عن قواعد التصنيف الفيروسي. يقوم نظام ICTV المستخدم هنا بتجميع الفيروسات على أساس التشابه الجيني والاحتكار المفترض. نظام التصنيف الفيروسي منفصل عن نظام التصنيف للكائنات الخلوية. يقوم نظام ICTV بتجميع الفيروسات ضمن سبعة أوامر تحتوي على عائلات ذات صلة. يوجد حاليًا عدد كبير من العائلات غير المخصصة ذات الصلات غير المعروفة بالأوامر السبعة. تصيب ثلاثة من هذه الأنواع يوباكتيريا أو أرتشيا أو النباتات فقط ولا تظهر في هذا الجدول. يمكن تقسيم بعض العائلات إلى عائلات فرعية. هناك أيضًا العديد من الأجناس غير المعينة. مثل جميع التصنيفات، فإن التصنيف الفيروسي في حالة تغير مستمر. يمكن الحصول على أحدث قائمة الأنواع الكاملة والتصنيف على موقع ICTV الإلكتروني. 2
مسببات الأمراض الفطرية
الفطريات هي إحدى ممالك مجال Eukarya. ترتبط الفطريات ارتباطًا وثيقًا بالحيوانات وعدد قليل من المجموعات الصغيرة الأخرى وترتبط بشكل أكبر بالنباتات والمجموعات الأخرى التي تم تصنيفها سابقًا على أنها بروتستانت. في الوقت الحاضر، تنقسم الفطريات إلى سبعة أنواع (أو أقسام، وهي فترة تعود إلى وقت دراسة الفطريات بالنباتات)، ولكن هناك شكوك حول بعض العلاقات. 3 العديد من مجموعات الفطريات، وخاصة تلك التي تم تصنيفها سابقًا في Phylum Zygomycota، والتي لم تكن أحادية النواة، لها علاقات غير مؤكدة بالفطريات الأخرى. النوع الوحيد المدرج في هذا الجدول الذي يندرج ضمن هذه الفئة هو Rhizopus arrhizus. تخضع الأسماء الفطرية للمدونة الدولية لتسميات الطحالب والفطريات والنباتات (4)، لكن اللجنة الدولية لتصنيف الفطريات (ICTF) تعزز أيضًا العمل التصنيفي على الفطريات. يتمثل أحد أنشطة ICTF في نشر تغييرات الأسماء للأنواع الفطرية الطبية وغيرها من الأنواع الفطرية المهمة. يتم الآن جمع العديد من الأنواع التي كان لها اسمان سابقًا (أحدهما للشكل الجنسي والآخر للشكل اللاجنسي) معًا تحت اسم واحد.
توزيع | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
أسكوميكوتا | الرشاشيات | نكهة | داء الرشاشيات الانتهازي |
الرشاشيات | فوميغاتوس | داء الرشاشيات الانتهازي | |
الأرومات الأريمية | التهاب الجلد | داء الفطار الأرومي | |
الكانديدا | البيض | مرض القلاع (داء المبيضات) | |
الكوكسيديويد | حد | حمى الوادي (الكوكسيديوفوميكوسيس) | |
إبيدرموفيتون | سعفة الجسم (السعفة)، سعفة القضيب (حكة الرقبة)، سعفة القضيب (قدم الرياضي)، سعفة الفم (فطار الأظافر) | ||
هيستوبلازما | كبسولة | داء النوسجات | |
ميكروسبوروم | التهاب سعفة الرأس (السعفة) وسعفة الجسم (السعفة) وفطريات جلدية أخرى | ||
التهاب الكيسات الرئوية | جيروفيتشي | الالتهاب الرئوي الانتهازي | |
سبورثريكس | شنكي | داء سبوروتريتشوسيس (مرض روز هاندلر) | |
تريشوفيتون | تختلف المينتروفيتات. بين الأجهزة الرقمية | سعفة الشعر (حكة الحلاق)، الفطريات الجلدية | |
تريشوفيتون | ربروم | سعفة الجسم (السعفة)، سعفة القضيب (حكة الرقبة)، سعفة القضيب (قدم الرياضي)، سعفة الفم (فطار الأظافر) | |
باسيديوميكوتا | المكورات العقدية | نيوفورمانز | المكورات الخفية الانتهازية والتهاب السحايا الفطري والتهاب الدماغ |
مالاسيزيا | قشرة الرأس والشعفة المبرقشة | ||
غير مؤكد | ريزوبوس | أريزوس | الفطار المخاطي |
مسببات الأمراض الأولية
إن العلاقات بين الكائنات الحية (وبالتالي تصنيفها) التي تم تجميعها سابقًا تحت اسم Protists مفهومة بشكل أفضل مما كانت عليه قبل عقدين أو ثلاثة عقود، ولكن هذا لا يزال العمل قيد التقدم. في عام 2005، تم تقسيم أوكاريا إلى ست مجموعات كبيرة. 5 جمع أحدث تصنيف عالي المستوى بين مجموعتين من المجموعات الفائقة السابقة لإنتاج نظام يضم خمس مجموعات فائقة. 6 تم تطوير هذا التصنيف لجمعية علماء البروتوزولوجيا، لكنه ليس النهج الوحيد المقترح. تشمل إحدى المجموعات الخمس الفائقة الحيوانات والفطريات وبعض مجموعات البروتيست الأصغر. يحتوي آخر على نباتات خضراء وثلاث مجموعات من الطحالب. تحتوي المجموعات الثلاث الكبرى الأخرى (المدرجة في الجداول الثلاثة أدناه) على المسببات الأولية الأخرى، وكثير منها يسبب المرض. بالإضافة إلى ذلك، هناك عدد كبير من المجموعات البدائية التي لا يتم فهم علاقاتها. في المجموعات الثلاث الفائقة الممثلة هنا، أشرنا إلى الفيلا التي تنتمي إليها مسببات الأمراض المدرجة.
فيلوم | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
أميبوزوا | أكانثامويبا | التهاب الدماغ الأميبي الحبيبي، التهاب القرنية الأكناموبي | |
أنتامويبا | هيستوليتيكا | داء السرميات |
فيلوم | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
مجمع أبيكو | بابيسيا | داء البابيزيا | |
كريبتوسبوريديوم | أشباه البشر | داء الكريبتوسبوريديوسيس | |
كريبتوسبوريديوم | عطر | داء الكريبتوسبوريديوسيس | |
سايكلوسبورا | كاييتانينسيس | التهاب المعدة والأمعاء | |
بلاسموديوم | فالسيباروم | الملاريا | |
بلاسموديوم | ملاريا | الملاريا «الحميدة» أو «الكوارتانية» (الحمى المتكررة لمدة 3 أيام) | |
بلاسموديوم | بيضوي | الملاريا «تيرتيان» (حمى متكررة لمدة يومين) | |
بلاسموديوم | vivax | الملاريا «الحميدة» «tertian» (الحمى المتكررة لمدة يومين) | |
بلاسموديوم | نولسي | الملاريا الرئيسية القادرة على الإصابة بمرض حيواني المنشأ وحمى الكوتيديان | |
التوكسوبلازما | جوندي | داء المقوسات |
فيلوم | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
ميتامونادا | الجيارديا | لامبليا | مرض الجيارديا |
تريتشوموناس | المهبل | داء المشعرات | |
اوجلينوزوا | الليشمانيا | برازيلينسيس | داء الليشمانيات |
الليشمانيا | دونوفاني | داء الليشمانيات | |
الليشمانيا | تروبيكا | داء الليشمانيات الجلدي | |
داء المثقبيات | بروسي | مرض النوم الأفريقي (داء المثقبيات الأفريقي) | |
داء المثقبيات | كروزي | مرض شاغاس | |
البيركلوزوا | نيجليريا | فوليري | التهاب السحايا والدماغ الأميبي الأولي (داء النجيليريات) |
الديدان الطفيلية
لا يزال تصنيف الديدان الطفيلية، التي تنتمي جميعها إلى مملكة Animalia، يحتوي على العديد من الشكوك. توجد الأنواع المسببة للأمراض في فيلتين: النيماتودا، أو الديدان الإسطوانية، وPlatyhelminthes، أو الديدان المسطحة. تنقسم النيماتودا مبدئيًا إلى فئتين 7، إحداهما، كرومادوريا، ربما تحتوي على مجموعات غير ذات صلة. توجد الديدان المفلطحة الطفيلية ضمن ثلاث فئات من الدودة المفلطحة، اثنتان منها مهمتان للإنسان، وهما الديدان المثقوبة والسيستود.
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
كرومادوريا | أنكيلوستوما | كانينوم | عدوى الدودة الشصية للكلاب |
أنكيلوستوما | الاثني عشر | عدوى الدودة الشصية في العالم القديم | |
أسكاريس | لومبريكويدس | داء الاسكارس | |
إنتيروبيوس | الفيرميكولار | داء السرميات (دودة الدبوس) | |
لوا | قرض | داء الفيلاريات المنخفض (دودة العين) | |
نكاتور | أمريكي | نيكاتوريسيس (عدوى الدودة الشصية في العالم الجديد) | |
سترونغليويدات | ستيركوراليس | داء سترونغيلويدياسيس | |
إينوبلا | تريشينيلا | اللولبية | داء المشعرات |
الترايخوريس | تريتشيورا | داء المشعرات (عدوى الدودة السوطية) |
فئة | نوع | الأنواع | الأمراض ذات الصلة |
---|---|---|---|
تريماتودا | كلونورشيس | سينينسيس | حظ الكبد الصيني |
فاسيولوبسيس | بوسكي | داء الفاسيولوبس | |
فاشيولا | عملاق | داء اللفافة | |
فاشيولا | التهاب الكبد | داء اللفافة | |
أوبيستورشيس | فيلينيوس | أوبيستورشياسيس | |
أوبيستورشيس | فيفريني | أوبيستورشياسيس | |
البلهارسيا | الهيماتوبيوم | داء البلهارسيات البولية | |
البلهارسيا | جابونيكوم | داء البلهارسيات | |
البلهارسيا | مانسوني | داء البلهارسيات المعوي | |
سيستودا | ديفيلوبوثريوم | لاتوم | ديفيلوبوثريوسيس |
إشينوكوكوس | الحبيبي | الكيسات المشوكات الكيسية (داء المشوكات الكيسي) | |
إشينوكوكوس | متعدد العدسات | داء المشوكات | |
تاينيا | عرق النسا | داء الشرينيات المعوي | |
تاينيا | ساجيناتا | داء الشرينيات المعوي | |
تاينيا | سوليوم | داء المشويات المعوية، داء الكيسات المذنبة |
الحواشي
- 1 الثقة اليدوية لبيرجي. دليل بيرجي لمنهجية الأركيا والبكتيريا، المخطط التصنيفي. 2012. http://www.bergeys.org/outlines.html
- 2 اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات. «قائمة الأنواع الرئيسية لـ ICTV.» http://talk.ictvonline.org/files/ict...l/default.aspx
- (3) الدكتور إس هيبيت وآخرون. «تصنيف عالي المستوى للتطور الفطري.» أبحاث الفطريات 111 رقم 5 (2007): 509-547.
- 4 جي ماكنيل وآخرون. المدونة الدولية لتسميات الطحالب والفطريات والنباتات (كود ملبورن). أوبيرريفنبرغ، ألمانيا. كتب كويلتز العلمية؛ 2012. http://www.iapt-taxon.org/nomen/main.php؟
- 5 إس إم عادل وآخرون. «التصنيف الجديد عالي المستوى لحقيقيات النوى مع التركيز على تصنيف الطلائع». مجلة الميكروبيولوجيا حقيقية النواة 52 رقم 5 (2005): 399—451.
- 6 إس إم عادل وآخرون. «التصنيف المنقح لحقيقيات النوى». مجلة علم الأحياء الدقيقة حقيقية النواة 59 رقم 5 (2012): 429-514.
- 7 المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية. «متصفح التصنيف: نيماتودا». http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy...ax.cgi؟ معرف = 6231