Skip to main content
Global

4.E: תרגילי ערכת כלים גנטיים

  1. Last updated
  2. Save as PDF
  • Page ID
    207739

    • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)\(\newcommand{\AA}{\unicode[.8,0]{x212B}}\)

    מועדון ג'ורנל

    הקריאה השבוע היא שלושה הרגלים של מסלולי איתות יעילים ביותר

    שאלות מדריך קריאה

    איתות מפעיל מתג

    1. מהם שלושת ההרגלים של מסלולי איתות?

    2. מהו SPRE ומה המשמעות שלו במסלולי איתות?

    3. מה עשויה להיות המטרה של הפעלה ניסיונית של מסלול איתות?

    אי ספיקה של מפעיל

    4. הגדר אי ספיקת מפעיל ואזורי יכולת

    5. כיצד מסבירים המחברים את הממצא ש-SPREs אינם מספיקים במבחנה, אך מספיקים בתאים מתורבתים?

    הפעלה שיתופית

    6. מהו מפעיל עצמאי לאות?

    7. מה המטרה של מפעילים משותפים?

    דיכוי ברירת מחדל

    8. כיצד אורגניזמים מתפתחים פותרים את בעיית הביטוי הדולף?

    9. השווה שני סוגים של דיכוי ברירת מחדל וכיצד איתות משחרר את ההדחקה

    שיקולים פונקציונליים/מכניסטיים/אבולוציוניים

    10. איזה תפקיד ממלא שינוי הכרומטין במפלי העברת אותות התפתחותיים?

    שאלות לדיון בכיתה

    איתות מפעיל מתג

    1. בחר הרגל אחד כדי להמחיש עם ציור.

    2. הסבר כיצד Notch, Wnt ו- Hh משיגים מיתוג תעתיק.

    אי ספיקה של מפעיל

    3. למה מתכוונים המחברים כשהם אומרים שמסלולי איתות מפגינים "היענות תעתיק סלקטיבית של גני מטרה לפעילות מסלול".?

    4. באילו דרכים תאים יכולים להגביל את ההפעלה של גן מטרה על ידי מסלול איתות מופעל?

    הפעלה שיתופית

    5. מהו חסרון פוטנציאלי להפעלה שיתופית?

    דיכוי ברירת מחדל

    6. להמחיש את הסוגים השונים של דיכוי ברירת המחדל

    7. הדגימו דוגמה אחת להדחקת ברירת מחדל

    שיקולים פונקציונליים/מכניסטיים/אבולוציוניים

    8. הסבר איור 5: איך זה סיכום של התפוקה של הרגלי מסלול איתות?

    9. הסבר כיצד Koide et al בדקו האם דיכוי ברירת המחדל נפרד מאי ספיקת מפעיל.

    תרגיל קבוצתי

    פעילות HHMI זו בוחנת את האבולוציה של cis-אלמנטים רגולטוריים. תוכלו להשלים את התרגיל מבלי לצפות בסרט המוצע (זמין ביוטיוב ובאתר HHMI).

    דוגמנות המתגים הרגולטוריים של הגן Pitx1 בדגי סטיקלבק