كان أصل الخلايا حقيقية النواة لغزًا إلى حد كبير حتى تم فحص الفرضية الثورية بشكل شامل في الستينيات من قبل لين مارغوليس. تنص نظرية الإندوسمات الحيوية على أن حقيقيات النوى هي نتاج خلية بدائية النواة تبتلع أخرى، وتعيش واحدة داخل أخرى، وتتطور معًا بمرور الوقت حتى لم يعد من الممكن التعرف على الخلايا المنفصلة على هذا النحو. هذه الفرضية التي كانت ذات يوم ثورية تتمتع بالإقناع الفوري وهي الآن مقبولة على نطاق واسع.