10.1: Bevezetés, Simpson-index és Shannon-Weiner index
- Page ID
- 205335
Erdő- és természeti erőforrás-kezelőként tisztában kell lennünk azzal, hogy fakezelési gyakorlataink hogyan befolyásolják azokat a biológiai közösségeket, amelyekben előfordulnak. Az erdőgazdálkodási recept nemcsak az általunk termesztett fát fogja befolyásolni, hanem az ezen állományokat lakó növény- és vadközösségeket is. A földtulajdonosok, mind állami, mind (18)} {d magántulajdonban vannak, gyakran megkövetelik a nem faanyagok, például a vadon élő állatok kezelését, valamint a fakezeléssel elért pénzügyi célok teljesítését. Az erőforrás-menedzsereknek tisztában kell lenniük a gazdálkodási gyakorlatoknak a növény- és vadon élő közösségekre gyakorolt hatásaival. A fa és a vadon élő állatok közötti elsődleges határfelület az élőhely, és az élőhely egyszerűen a fajok túléléséhez szükséges környezeti tényezők (pl. Táplálék vagy borítás) ötvözete. A legtöbb vadon élő állat élőhelyének kulcsfontosságú összetevője a növényzet, amely táplálékot és szerkezeti burkolatot biztosít. A fa- és vadgazdálkodási célokat ötvöző előírások létrehozása kulcsfontosságú a rendszer fenntartható, hosszú távú egyensúlyához.
Tehát hogyan dolgozzunk ki egy olyan tervet, amely több földhasználati célt is magában foglal? A tudás a kulcs. Információra van szükségünk az érdeklődő vadon élő fajok által igényelt élőhelyről, és tisztában kell lennünk azzal, hogy a fakitermelés és az azt követő regeneráció hogyan befolyásolja a rendszer vegetatív jellemzőit. Más szóval, meg kell értenünk a közösségben jelen lévő organizmusok sokféleségét, és értékelnünk kell, hogy irányítási gyakorlataink milyen hatással lesznek erre a rendszerre.
Az élőlények sokfélesége és a sokféleség mérése régóta érdekli az ökológusokat és a természeti erőforrás-kezelőket. A sokféleség változatosság, és legegyszerűbb szintjén magában foglalja a fajok számlálását vagy felsorolását. A biológiai közösségek különböznek az általuk tartalmazott fajok számától (gazdagságától) és e fajok relatív bőségétől (egyenletesség). A fajgazdagság önmagában nem veszi figyelembe az egyes fajok egyedeinek számát. Azonos súlyt ad azoknak a fajoknak, amelyekben kevés egyed van, mint a sok egyedű fajnak. Így egyetlen sárga nyírfa ugyanolyan hatással van egy terület gazdagságára, mint 100 cukorjuharfa. Az egyenletesség a terület gazdagságát alkotó különböző fajok relatív bőségének mértéke. Tekintsük a következő példát.
Példa \(\PageIndex{1}\):
Fafajok |
1. minta |
2. minta |
---|---|---|
Cukor juhar |
167 |
391 |
Bükk |
145 |
24 |
Sárga nyír |
134 |
31 |
Mindkét minta azonos gazdagságú (3 faj) és azonos számú egyed (446). Az első minta azonban egyenletesebb, mint a második. Az egyedek száma egyenletesebben oszlik meg a három faj között. A második mintában az egyedek többsége cukorjuhar, kevesebb bükk- és sárga nyírfával. Ebben a példában az első mintát változatosabbnak tekintjük.
A diverzitási index egy kvantitatív mérőszám, amely tükrözi a különböző fajok számát és azt, hogy az egyedek mennyire egyenletesen oszlanak el e fajok között. Jellemzően a diverzitási index értéke növekszik, ha a típusok száma növekszik és az egyenletesség növekszik. Például a nagyszámú, egyenletesen elosztott fajjal rendelkező közösségek a legváltozatosabbak, és a kevés fajjal rendelkező közösségek, amelyekben egy faj dominál, a legkevésbé változatosak. A fajok sokféleségének számos közös mérőszámát fogjuk megvizsgálni.
Simpson indexe
Simpson (1949) kifejlesztett egy diverzitási indexet, amelyet a következőképpen számítanak ki:
\[D = \sum^R_{i=1} (\dfrac {n_i(n_i-1)}{N(N-1)})\]
ahol n i az i faj egyedeinek száma, N pedig a mintában szereplő fajok teljes száma. Egy ekvivalens képlet:
\[D = \sum^R_{i=1} p_i^2\]
ahol \(p_i\) az egyes fajok arányos bősége és R a mintában szereplő fajok teljes száma. A Simpson-index az arányos bőség súlyozott számtani átlaga, és annak valószínűségét méri, hogy a mintából véletlenszerűen kiválasztott két egyed ugyanahhoz a fajhoz tartozik. Mivel a fajok arányos abundanciájának átlaga növekszik a fajok számának csökkenésével és a legelterjedtebb fajok számának növekedésével, a D értéke kis értékeket kap a nagy diverzitású adathalmazokban és nagy értékeket az alacsony diverzitású adatkészletekben. A Simpson D értéke 0 és 1 között mozog, a 0 végtelen sokféleséget, az 1 pedig nem jelent diverzitást, tehát minél nagyobb az értéke\(D\), annál alacsonyabb a diverzitás. Emiatt a Simpson-indexet általában inverzként (1/ D) vagy bókként (1-D) fejezik ki, amelyet Gini-Simpson indexnek is neveznek. Nézzünk egy példát.
Példa \(\PageIndex{2}\):calculating Simpson’s Index
Ki akarjuk számítani a Simpson-ét erre \(D\) a hipotetikus közösségre, három fajjal.
Faj |
Személyek száma |
---|---|
Cukor juhar |
35 |
Bükk |
19 |
Sárga nyír |
11 |
Először számítsa ki N.
\[N = 35 + 19 + 11 = 65 \nonumber \]
Ezután számítsa ki az indexet az egyes fajok egyedszámának felhasználásával:
\[D = \sum^R_{i=1} (\dfrac {n_i(n_i-1)}{N(N-1)}) = (\frac {35(34)}{65(64)} +\frac {19(18)}{65(64)} + \frac {11(10)}{65(64)}) = 0.3947 \nonumber \]
Az inverz a következő:
\[\frac {1}{0.3947} = 2.5336 \nonumber \]
Az inverz használatával ennek az indexnek az értéke 1-gyel kezdődik, mint a lehető legalacsonyabb érték. Minél nagyobb ennek az inverz indexnek az értéke, annál nagyobb a sokféleség. Ha Simpson D-jének bókját használjuk, akkor az érték:
\[1-0.3947 = 0.6053 \nonumber \]
Az index ezen verziójának értéke 0 és 1 között van, de most, minél nagyobb az érték, annál nagyobb a minta sokfélesége. Ez a bók azt a valószínűséget képviseli, hogy a mintából véletlenszerűen kiválasztott két egyed különböző fajokhoz tartozik. Nagyon fontos egyértelműen kijelenteni, hogy a Simpson D melyik verzióját használja a sokféleség összehasonlításakor.
Shannon Weiner Index
A Shannon-Weiner indexet (Barnes et al. 1998) az információelméletből fejlesztették ki, és a bizonytalanság mérésén alapul. A véletlenszerű minta fajainak előrejelzésének bizonytalansága összefügg a közösség sokféleségével. Ha egy közösség diverzitása alacsony (egy faj uralja), akkor az előrejelzés bizonytalansága alacsony; valószínűleg egy véletlenszerűen mintavételezett faj lesz a domináns faj. Ha azonban a sokféleség magas, a bizonytalanság magas. Ezt a következőképpen számítják ki:
\[H' = -\sum^R_{i=1} ln(p_i) = ln (\frac {1}{\prod^R_{i=1} p^{p_i}_i})\]
ahol p i az i fajhoz tartozó egyedek aránya, R pedig a mintában szereplő fajok száma. Mivel a p i összege definíció szerint egységgel egyenlő, a nevező megegyezik a p i értékek súlyozott geometriai átlagával, súlyként a p i értékeket használva. A zárójelben szereplő kifejezés megegyezik a valódi diverzitással D és H'=ln (D). Ha az adathalmaz összes faja egyformán gyakori, akkor minden p i érték = 1/ R és a Shannon-Weiner index egyenlő ln (R). Minél egyenlőtlenebb a fajok száma, annál nagyobb a p i értékek súlyozott geometriai átlaga, annál kisebb az index. Ha a bőség elsősorban egy fajra koncentrálódik, az index nulla közelében lesz.
Egyenértékű és számításilag könnyebb képlet a következő:
\[H' = \frac {N ln \ N -\sum (n_i ln \ n_i)}{N}\]
ahol N a fajok teljes száma és n i az i faj egyedeinek száma. A Shannon-Weiner index a legérzékenyebb a mintában szereplő fajok számára, ezért általában elfogultnak tekintik a fajgazdagság mérése felé.
Számítsuk ki a Shannon-Weiner diverzitási indexet ugyanarra a hipotetikus közösségre az előző példában.
Példa \(\PageIndex{3}\):Calculating Shannon-Weiner Index
Faj |
Személyek száma |
Cukor juhar |
35 |
Bükk |
19 |
Sárga nyír |
11 |
Tudjuk, hogy N = 65. Most számítsuk ki az indexet:
\[H' = \dfrac {271.335 - (124.437+55.944+26.377)}{65}=0.993 \nonumber \]