Skip to main content
Global

17.2B: מפות פיזיות ושילוב עם מפות גנטיות

  1. Last updated
  2. Save as PDF
  • Page ID
    209648

    • Boundless
    • Boundless
    \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)\(\newcommand{\AA}{\unicode[.8,0]{x212B}}\)

    מפות פיזיות מציגות את המרחק הפיזי בין גנים וניתן לבנות אותן באמצעות מיפוי ציטוגנטי, היברידי קרינה או רצף.

    מטרות למידה
    • תאר את השיטות המשמשות למיפוי פיזי של גנים: מיפוי ציטוגנטי, מיפוי היברידי קרינה ומיפוי רצפים

    נקודות מפתח

    • מפות פיזיות מספקות פירוט מפורט לגבי מספר הבסיסים והמרחק הפיזי הקיים בין סמנים גנטיים.
    • מיפוי ציטוגנטי הוא שיטה המשמשת לבניית מפות פיזיות המשתמשת בקטעים מוכתמים של כרומוזומים כדי להעריך את המרחק בין סמנים גנטיים.
    • מיפוי היברידי קרינה הוא שיטה המשמשת לבניית מפות פיזיות המשתמשות בקרינה או בקרני רנטגן כדי לשבור DNA לשברים כדי לקבוע את המרחק בין סמנים גנטיים וסדרם בכרומוזום.
    • מיפוי רצפים הוא שיטה המשמשת לבניית מפות פיזיות המשתמשת במיקומים ידועים כבר של סמנים גנטיים כדי לקבוע מרחקים במספר זוגות בסיסים.

    מונחי מפתח

    • ציטוגנטי: של או קשור למקור והתפתחות של תאים
    • מפה פיזית: מפה המראה כמה DNA מפריד בין שני גנים ונמדד בזוגות בסיסים
    • תג רצף מבוטא: תת-רצף קצר של רצף cDNA שעשוי לשמש לזיהוי תמלילי גנים

    מפות פיזיות

    מפה פיזית מספקת פירוט של המרחק הפיזי בפועל בין סמנים גנטיים, כמו גם את מספר הנוקלאוטידים. ישנן שלוש שיטות המשמשות ליצירת מפה פיזית: מיפוי ציטוגנטי, מיפוי היברידי קרינה ומיפוי רצפים. מיפוי ציטוגנטי משתמש במידע המתקבל על ידי ניתוח מיקרוסקופי של חלקים מוכתמים בכרומוזום. ניתן לקבוע את המרחק המשוער בין סמנים גנטיים באמצעות מיפוי ציטוגנטי, אך לא את המרחק המדויק (מספר זוגות הבסיס). מיפוי היברידי של קרינה משתמש בקרינה, כגון צילומי רנטגן, כדי לפרק את ה- DNA לשברים. ניתן להתאים את כמות הקרינה ליצירת שברים קטנים יותר או גדולים יותר. טכניקה זו מתגברת על המגבלה של מיפוי גנטי ואינה מושפעת מתדירות רקומבינציה מוגברת או מופחתת. מיפוי רצפים נבע מטכנולוגיית רצף DNA שאפשרה יצירת מפות פיזיות מפורטות עם מרחקים שנמדדו במונחים של מספר זוגות הבסיס. יצירת ספריות גנומיות וספריות DNA משלימות (cDNA) (אוספים של רצפים משובטים או כל ה- DNA מגנום) האיצה את תהליך המיפוי הפיזי. אתר גנטי המשמש ליצירת מפה פיזית עם טכנולוגיית רצף (אתר מתויג ברצף, או STS) הוא רצף ייחודי בגנום עם מיקום כרומוזומלי מדויק ידוע. תג רצף מבוטא (EST) ופולימורפיזם באורך רצף יחיד (SSLP) הם STSs נפוצים. EST הוא STS קצר המזוהה עם ספריות cDNA, בעוד SSLPs מתקבלים מסמנים גנטיים ידועים ומספקים קשר בין מפות גנטיות למפות פיזיות.

    דמות
    איור\(\PageIndex{1}\): מפה ציטוגנטית: מפה ציטוגנטית מציגה את המראה של כרומוזום לאחר שהוא מוכתם ונבדק במיקרוסקופ.

    שילוב מפות גנטיות ופיזיות

    מפות גנטיות מספקות את המתאר ומפות פיזיות מספקות את הפרטים. קל להבין מדוע שני סוגי טכניקות מיפוי הגנום חשובים כדי להראות את התמונה הגדולה. מידע המתקבל מכל טכניקה משמש בשילוב לחקר הגנום. נעשה שימוש במיפוי גנומי עם אורגניזמים שונים של מחקר מודלים. מיפוי הגנום הוא תהליך מתמשך; ככל שמתפתחות טכניקות טובות יותר, צפויות התקדמות רבה יותר. מיפוי הגנום דומה להשלמת פאזל מסובך באמצעות כל פיסת נתונים זמינה. מידע מיפוי שנוצר במעבדות ברחבי העולם מוזן למאגרי מידע מרכזיים, כגון GenBank במרכז הלאומי למידע ביוטכנולוגי (NCBI). נעשים מאמצים להפוך את המידע לנגיש יותר לחוקרים ולציבור הרחב. בדיוק כפי שאנו משתמשים במערכות מיקום גלובליות במקום במפות נייר כדי לנווט בכבישים, NCBI יצרה כלי לצפייה בגנום כדי לפשט את תהליך כריית הנתונים.

    תרומות וייחוסים

    • מכללת OpenStax, ביולוגיה. 16 באוקטובר 2013. מסופק על ידי: אופנסטקס CNX. ממוקם בכתובת: http://cnx.org/content/m44554/latest...ol11448/latest. רישיון: CC BY: ייחוס
    • RFLP. מסופק על ידי: ויקיפדיה. ממוקם בכתובת: en.wikipedia.org/ויקי/RFLP. רישיון: CC BY-SA: ייחוס-שיתוף זהה
    • מיקרו-סאטלייט. מסופק על ידי: ויקימילון. ממוקם בכתובת: en.wiktionary.org/ויקי/מיקרו-לווין. רישיון: CC BY-SA: ייחוס-שיתוף זהה
    • SNP. מסופק על ידי: ויקימילון. ממוקם בכתובת: en.wiktionary.org/ויקי/SNP. רישיון: CC BY-SA: ייחוס-שיתוף זהה
    • פולימורפיזם. מסופק על ידי: ויקימילון. ממוקם בכתובת: en.wiktionary.org/wiki/פולימורפיזם. רישיון: CC BY-SA: ייחוס-שיתוף זהה
    • מכללת OpenStax, מיפוי גנומים. 16 באוקטובר 2013. מסופק על ידי: אופנסטקס CNX. ממוקם בכתובת: http://cnx.org/content/m44554/latest...e_17_02_01.jpg. רישיון: CC BY: ייחוס
    • מכללת OpenStax, ביולוגיה. 16 באוקטובר 2013. מסופק על ידי: אופנסטקס CNX. ממוקם בכתובת: http://cnx.org/content/m44554/latest...ol11448/latest. רישיון: CC BY: ייחוס
    • מכללת OpenStax, ביולוגיה. 23 באוקטובר 2013. מסופק על ידי: אופנסטקס CNX. ממוקם בכתובת: http://cnx.org/content/m44554/latest/?collection=col11448/latest. רישיון: CC BY: ייחוס
    • תג רצף מבוטא. מסופק על ידי: ויקיפדיה. ממוקם בכתובת: en.wikipedia.org/ויקי/אקספרס... רצף% 20 תג. רישיון: CC BY-SA: ייחוס-שיתוף זהה
    • ציטוגנטי. מסופק על ידי: ויקימילון. ממוקם בכתובת: en.wiktionary.org/ויקי/ציטוגנטי. רישיון: CC BY-SA: ייחוס-שיתוף זהה
    • מפה פיזית מסופק על ידי: ויקימילון. ממוקם בכתובת: en.wikitionary.org/ויקי/פיסיקל_מפה. רישיון: CC BY-SA: ייחוס-שיתוף זהה
    • מכללת OpenStax, מיפוי גנומים. 16 באוקטובר 2013. מסופק על ידי: אופנסטקס CNX. ממוקם בכתובת: http://cnx.org/content/m44554/latest...e_17_02_01.jpg. רישיון: CC BY: ייחוס
    • מכללת OpenStax, מיפוי גנומים. 16 באוקטובר 2013. מסופק על ידי: אופנסטקס CNX. ממוקם בכתובת: http://cnx.org/content/m44554/latest...e_17_02_02.jpg. רישיון: CC BY: ייחוס